杰西卡·巴拉

海洋生物系副教授

Jessica Labonté


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海洋与海岸研究所267室


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在你的生活中是什么吸引你进入你现在的研究领域的?

从很小的时候起,我就一直对科学感兴趣,并对了解我们生活的世界充满好奇。在上大学之前,我不确定自己想做什么,只知道我想成为一名研究人员。直到我在生物学导论课程中发现了遗传学和微生物的巨大多样性,我才决定成为一名微生物学家。

在拉瓦尔大学攻读微生物学本科期间,我选修了一门食品微生物学课程,我非常喜欢这门课程,因此我决定跟随拉瓦尔大学的Sylvain Moineau博士攻读食品微生物学硕士学位。我正在研究噬菌体(细菌的病毒)感染乳酸菌嗜热链球菌的特异性,用于发酵牛奶生产酸奶和马苏里拉奶酪。

当我专注于研究噬菌体附着在宿主上的一种特定蛋白质时,我意识到我想在大自然的宏伟计划中对病毒有一个更大的了解。就在那时,我决定在不列颠哥伦比亚大学柯蒂斯·萨特尔博士的实验室攻读博士学位,并将我的研究重点从单一病毒及其宿主转向整个环境病毒群落。我的论文关注的是不同海洋环境中ssDNA病毒的多样性和进化。我开发了一种从病毒群落中提取ssDNA的方法,并使用宏基因组学来表征它们的多样性。我被海洋病毒惊人的多样性迷住了。从那一刻起,我知道我必须继续研究海洋。

当我在研究病毒的多样性时,我对了解它们的宿主也越来越感兴趣。我的第一个博士后是在毕格罗海洋科学实验室和Ramunas Stepanauskas博士一起完成的,用单细胞基因组学研究病毒与宿主的相互作用。当对单个细胞进行测序时,你可以对细胞内的一切进行测序,包括病毒感染!利用单细胞基因组学,我能够将未培养的病毒与其未培养的宿主联系起来。

在我的第一个博士后期间,我开始研究来自地球表面以下3公里的样本(来自南非的一个金矿)。我发现了一个全新的世界:地下!为了追求这个新的激情,我在毕格罗海洋科学实验室和贝丝·奥克特博士一起做了第二个博士后。我开始描述生活在海底下,沉积物和海洋地壳中的微生物群落。

现在,作为一名研究人员,我把我在研究中获得的所有经验结合起来,研究水生系统(海洋和地下)中病毒与宿主的相互作用。我的研究是尊龙凯时APP通过表征病毒与宿主的关系来研究病毒在水生环境中的作用。我结合实验室培养、分子生物学技术和生物信息学来:

  • 描述和解释病毒和微生物的时空多样性
  • 表征模式生物和环境系统中噬菌体与宿主的相互作用
  • 了解病毒和细菌在环境中的进化机制


你希望你的学生从和你一起学习或工作中获得什么?

我希望学生们养成良好的实验习惯。我的实验室获得了生物安全二级认证,重要的是,在我实验室工作的人都要明白这意味着什么,以及他们所做的一切都可能成为污染源。我希望我的学生有很强的科学头脑,这样他们就能设计出带有适当控制的实验,并对科学论文进行评论。所有本科生都必须从基本的实验室维护开始(清洁,去污,高压灭菌,准备溶液)。一旦他们了解了微生物实验室是如何工作的,我就会给他们分配一个当前的项目,这样他们就会受到挑战,但也会了解如何进行研究。

在你的个人生活中,你对什么充满激情?

我喜欢和我的丈夫马修以及我们的两只可爱的实验室,埃斯彭和道尔顿在一起。我喜欢露营和徒步旅行,也喜欢探索我的新家。

我每周跑很多次,今年我参加了我的第一次马拉松,休斯顿马拉松。

尊龙凯时
博士学位。 微生物学与免疫学英属哥伦比亚大学,2013年
硕士 微生物学,拉瓦尔大学,2005
数学学士微生物学,拉瓦尔大学,2003
课程

MARB 482:海洋生物学研讨会MARB 433/633:应用生物信息学MARB 6590:地球微生物学

出版物
J. M. labont<s:1>。, M. A. Lever, K. J. Edwards, B. N. Orcutt. 2017。火成岩基底对东胡安德富卡山脊侧翼深层沉积物微生物多样性的影响。微生物学前缘,8(4):1434。 doi: 10.3389 / fmicb.2017.01434

Stepanauskas, R, E. A. Fergusson, J. Brown, N. J. Poulton, B. Tupper, J. M. labont<e:1>, E. D. Becraft, J. M. Brown, M. G. Pachiadaki, T. Povilaitis, b.p. Thompson, C. J. Mascena, W. K. Bellows, Arvydas Lubys. 2017。改进的基因组恢复和单个未培养的微生物细胞和病毒颗粒的综合细胞大小分析。自然通讯。 doi: s41467 - 017 - 00128 - z

J. M. labont<s:1>。, B. K. Swan, B. Paulos, H. Luo, S. Koren, S. J. Hallam, M. B. Sullivan, T. Woyke, E. K. Wommack, R. Stepanauskas. 2015。海洋表面浮游细菌中病毒-宿主相互作用的单细胞序列分析。[j] .中国生物医学工程学报。9,2386-2399。 doi: 10.1038 / ismej.2015.48

J. M. labont<s:1>。, E. K. Field, M. Lau, E. Van Heerden, T. L. Kieft, T. C. Onstott, R. Stepanauskas。单细胞基因组学表明在深地下厚壁菌群中水平基因转移和病毒感染。前沿Microbiol。 doi: 10.3389 / fmicb.2015.00349

J. M. labont<s:1>。C. A.萨特尔,2013。以前未知的高度分化的ssDNA病毒在海洋中大量存在。2013. [j] .科学通报,7(2):389 - 397。 doi: 10.1038 / ismej.2013.110

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J. M. labont<s:1>。S. J. Hallam, C. A. Suttle. 2015。在沿海海洋环境的缺氧和缺氧水域中,以前未知的进化群体主导着ssDNA gokushovirus。微生物学前沿。 doi: 10.3389 / fmicb.2015.00315

J. M. labont<s:1>。K. E. Reid和C. A. Suttle, 2009。系统发育分析表明,海洋足病毒DNA聚合酶基因序列具有进化多样性和环境分离性。苹果环境微生物学报75:3634-3640。 doi: 10.1128 / AEM.02317-08

Deveau H., R. Barrangou, J. E. Garneau j·巴拉, C. Fremaux, P. Boyaval, D. a . Romero, P. Horvath和S. Moineau. 2008。嗜热链球菌对crispr编码耐药的噬菌体反应。[J] .中国生物医学工程学报。 doi: 10.1128 / JB.01412-07

Le Bourgeois, P., M. Bugarel, N. Campo, M. L. Daveran-Mingot, j·巴拉, D. Lanfranchi, T. Lautier, C. Pages和P. Ritzenthaler. 2007。链球菌/乳球菌的非常规Xer重组机制。公共科学图书馆麝猫。 doi: 10.1371 / journal.pgen.0030117
助学金及研究金
NSF-Biological海洋学:哈维飓风和休斯顿地区洪水对加尔维斯顿湾微生物群落的干扰和恢复(52,033美元)

暗能量生物圈研究中心:缺氧海洋盆地的海底原核生物和病毒群落及其相互作用:来自3000年前地层演替的案例研究(80,000美元)
专业的约会
2017 - 2020: 美国科学海洋钻探咨询委员会(USAC)成员

2016年至今: 助理教授最新体育赛事资讯、实时赔率分析及在线投注平台农工大学加尔维斯顿分校海洋生物系教授

2012 - 2016: 博士后研究科学家毕格罗海洋科学实验室

2014 - 2016: 研究科学家科尔比学院
研究生

克里斯塔·凯利,博士生

Royoung Park,博士生

乔丹·沃克,博士生

米莱娜罗德里格斯-皮尔科,硕士研究生

韦斯利·艾德,硕士研究生